1、源于子姓。商朝末，纣王叔父比干，商之贤臣，因直谏而被杀，子孙避难改姓，其中一支以本为王族子孙之故，遂姓孙氏。
2、源于姬姓。公元前1055年，周公姬旦封康叔於卫（今河南淇县），建立卫国。春秋时，他的八世孙姬和因为攻灭西戎有功，被周平王赐为公爵，史称卫武公。卫武公有一个儿子名叫惠孙，惠孙的孙子名乙，字武仲，又叫武仲乙，把祖父惠孙的字作为姓氏，姓孙。因此武仲乙又称孙乙，他的后代就以孙为姓。
3、源于妫 姓和姚姓。 《新唐书·宰相世系》：”舜后胡公妫满封陈，至敬仲仕齐，又为田氏。王莽封田丰为代眭侯，后丰子田恢为避王莽之乱，过江徙居吴郡，改为妫姓。其五代孙妫敷，又改为姚氏。 “ 《古今姓氏书辩证》记载：”舜因生于姚墟而姓姚，因居妫水而姓妫，故姚恢改姓为妫， 妫皓又改姓为姚，知姚与妫可通....... 武王时有虞遏父者，以奉虞帝之祀，是为胡公” 。 北宋景佑年间刊本：邵思著《姓解》记载：”“虞舜生于姚，故因生地为姓，后世有以姚为氏。“ 《元和姓纂》载：“姚，虞帝生于姚墟，子孙以姚为氏。”《尚书·尧典》记，舜“厘降二女于妫汭，嫔于虞。 舜在当帝之前，四岳（四方部族首领）曾向帝尧推荐过舜，尧把自己的两个女儿嫁给他，让他们居住在妫河边。他们的子孙有留在妫河边居住的，便以妫为姓。 南宋的《通志·氏族略》记载：“姚姓，虞之姓也，虞帝生于姚墟，故因生以为姓” ，舜因生在姚墟，其后子孙即以地为氏，称为姚氏。可见舜文化、虞舜文化和世界舜裔宗亲联谊会（世界舜裔联谊会），《古今姓氏书辩证》：“春秋时齐厉公之子田完之四世孙为 须无 ，无宇之少子名书，字子占，为齐大夫，伐莒有功，齐景公赐姓孙氏，食采乐安，孙武为其后。”公元前1046年，周灭商，周武王封舜帝的直系后裔妫满于陈国。公元前672年，陈厉公妫跃之子陈完逃奔齐国，改陈氏为田氏。齐景公时，陈完四世孙是须无，须无孙田桓子，即齐大夫田无宇，其子田书因伐莒有功，齐景公封田书于乐安，古城在今山东 惠民县，并赐姓孙氏。
4、源于芈姓。春秋初，楚王蚣冒之孙蒍贾，蒍贾之子蒍艾腊，也称孙叔敖，孙叔为其字，出任楚庄王的令尹，其子孙以其字为氏。 
5、源于荀姓。汉朝时，因汉皇室成员刘询当了皇帝，即汉宣帝，为了要避“询”音之讳，他下令荀姓子孙不得再姓荀，一律改为孙氏，并将战国时代的荀卿都改为孙卿。由是荀姓也成为汉朝“孙”姓支脉的一个源头。
6、源于冒姓，属于因故改姓为氏。夏侯婴，与刘邦是少时朋友，夏侯婴做过“滕令奉车”官职。等到其曾孙夏侯颇娶公主为妻，该公主随母亲外家的姓，称“孙公主”，这使夏侯颇的子女也跟随母亲外家的姓为孙。
7、源于其他赐姓、改姓：
①属于以王侯赐姓为氏。
三国时期东吴将领俞河因功而被赐姓孙，因称孙河。孙河，本姓俞，年少时即随孙坚征讨沙场，孙坚视他作心腹。后又随孙策平定江东，多立战功，孙策赐姓予他为孙，因而改姓。
②属于避难改姓为氏。
⑴山东《郓城县志》据李集乡军李村《李氏族谱》记载，李氏原姓轩辕氏，先祖轩辕斌，明初在朝为官，奉命往梁山平乱，便落籍郓城。后因奸臣陷害，为避灭门之祸，遂将轩辕氏改为孙、轩、李三姓，隐居四方。
⑵史籍《明史》记载，明朝中叶，有一名士叫孙一元，原来是安化王的宗族后裔，本为朱氏。明永乐十九年（公元1492年），庆靖王朱栴的第四子朱寘鐇承袭了安化的封地（今陕西庆阳与甘肃安化一带）。这个朱寘鐇曾一直认为自己是皇位当选人。事后，朱一元怕受株连，所以变姓名为孙一元，携家避难躲入太白山中隐居。在朱一元的后裔子孙中，皆沿袭祖先所改之姓氏，称孙氏，世代相传。
③源于各民族变姓，属于汉化改姓为氏。
《晋书》记载前燕孙氏，鲜卑族。羯族有孙氏。
⑴新 罗初期，高丽汉文学家金富轼撰著的《三国史记》中记述了孙氏的起源。新罗初期，朝鲜遗民分居山谷之间，分别为阏川杨山部、茂山大树部等六部，均以朴为姓。到新罗第三代王朴儒理尼师改六部名称，并分别赐姓，其中的茂山大树部改名渐梁部，并赐姓孙。
⑵唐朝时期，安禄 山的部将孙孝哲，官至大将军，安禄山僭位后拜殿中少监，为契丹族人。五代时期契丹和大贺氏结盟时候，契丹审密氏被赐姓孙。
⑶元代时期，曾任大都督的塔海，其后世子孙改姓孙，定居于山西省唯一的蒙古族聚居村——盂县秀水镇东白水村。
⑷明朝初年，朱元 璋禁止臣民使用胡姓， 胡姓多为复姓，如公孙、叔孙，长孙，土孙、王孙、孟孙、仲孙、季孙、室孙、宫孙之类的复姓也在被禁之例，这类含“孙”字的复姓不得不省字而改孙氏。
⑸清朝时期，满洲八旗姓孙佳氏全族改孙氏。满族建立清朝之后，仿汉姓成普遍现象，孙佳氏取其首音，选“孙”作为姓。另有鲁布哩氏改姓孙氏。
⑹在景颇族的二十六个大姓中，格亮姓是景颇族的祖先，其他各姓都是由她繁衍而出的，格亮姓汉化为孙氏。另有木如氏、堵引氏等小姓的汉姓也都改为孙氏。另外，佤族中的木依库氏音译为孙氏。在今苗族、阿昌族、哈尼族、土家族、黎族、傣族等少数民族中，均有孙氏族人分布，其来源大多是在唐、宋、元、明、清时期中央政府推行的羁糜政策及改土归流运动中，流改为汉姓孙氏，世代相传至今。